针对江苏突发性水稻病害（如条纹叶枯病、黑条矮缩病）开展抗病种质筛选、基因发掘、育种应用及分子改良技术研究；针对稻瘟病尤其是穗颈瘟，开展江苏粳稻抗穗颈瘟分子设计育种研究，创制新品种/种质；针对克隆的有重要育种应用潜力的性状基因，开发特异分子标记，研究其在江苏粳稻中的育种效应，创制优异新种质。