大多数重要的农艺性状是复杂性状，复杂性状的形成往往受到多个遗传位点和环境条件的影响，导致产生表型可塑性（Phenotypic Plasticity）。表型可塑性的产生很大程度上依赖于编码基因之外的包括DNA分子甲基化、非编码RNA分子、染色质组蛋白修饰和染色质开放性等在内的表观遗传因子的参与(Yang and Mackenzie, 2019)。理解复杂性状的遗传学分子基础和遗传规律是农业科学乃至整个生物学的最重要的核心科学问题。

   可遗传的表观遗传因子能够对编码基因进行转录水平和转录后水平的调控，与开花期(Yang et al., 2015)、春化作用(Xi et al., 2020)、种子形成(Han et al., 2019)、 组织再生(Jing et al., 2020)、根系发育(Shahzad et al., 2020)、生物钟周 期(Tian et al., 2021)和杂种优势(Ng et al., 2014)等重要性状密切相关。近 年来，表观遗传因子对园艺作物产量和品质形成的贡献被逐步揭示，相关研究表明，DNA甲基化影响了番茄(Zuo et al., 2020)、甜橙(Huang et al., 2019) 果实发育和油棕果实品质(Ong-Abdullah et al., 2015);非编码小片段RNA影响百脉根根瘤(Okuma et al., 2020)和黄瓜性母细胞形成(Huang et al., 2020); 组蛋白修饰影响番茄座果(Hu et al., 2021)和黄瓜形态建成(Yang et al., 2020)。对表观遗传基因组的解析已经成为全面理解园艺作物产量、品质形成和抗逆性分子机理及进行种质资源创制的不可或缺的重要组成部分，也为解决园艺 作物生产中存在的问题提供了新的思路。

   黄瓜遗传发育创新团队表观遗传小组以黄瓜为模式生物，深入研究包括DNA分子甲基化、非编码RNA分子、染色质组蛋白修饰和染色质开放性等在内的表观遗传因子对黄瓜果实品质形成与逆境抗性能力的贡献。