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- 国家自然科学基金面上项目：水稻Wx-lsv基因调控低分子量直链淀粉合成的分子机制及其育种利用，2019-2022,
- 国家自然科学基金-区域联合基金项目子课题：籼型杂交稻亲本食味品质相关优异基因（等位基因）的挖掘与效应评价，2020-2023,
- 国家自然科学基金青年基金：水稻Wx-lsv基因控制高直链、低黏滞特性淀粉合成的分子机制研究，2015-2017,张昌泉,
- 国家重点研发计划项目子课题：稻米外观、营养和健康功能品质形成与改良的分子基础，2016-2020,
- 国家农业重大科技项目子课题：优质食味早熟晚粳水稻新种质创新，2022-2023,
- 江苏省自然科学基金青年基金：一个水稻Wx新等位基因的表达调控机制研究，2015-2017,张昌泉,
- 江苏省重点研发计划子课题：高产粳稻优质基因鉴定和新材料创制，2018-2021,
- 江苏省种业振兴揭榜挂帅项目子课题：水稻优质功能基因挖掘和新材料创制，2021-2026,
- 江苏省高等学校自然科学研究重大项目：稻米透明度形成的淀粉结构基础及遗传改良，2019-2022,
- 江苏省农业自主创新项目：优良食味水稻种质资源创新与利用，2020-2022,
- 高等学校博士学科点专项科研基金：利用重测序的染色体片代换系精细定位和克隆控制稻米淀粉黏滞性谱和蛋白质含量QTL，2014-2016,张昌泉,
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